S manželkou, herečkou a producentkou Deborrou Lee-Furness, se seznámil během svého prvního natáčení v roce 1995 během australského seriálu Correlli. Tehdy byl Hugh Jackman ještě neznámou tváří a Deborra byla o třináct let starší. Mezi nimi však rychle přeskočila jiskra, a o rok později už se stali manželi. Jejich manželství trvalo téměř tři dekády.
Během této dlouhé doby se museli vypořádávat s předsudky kvůli velkému věkovému rozdílu. Hugh Jackman však vždy hájil svou ženu a nebral věk jako překážku. Mnohem větším problémem bylo zjištění, že nemohou mít společné biologické děti. Po několika neúspěšných pokusech o těhotenství se rozhodli pro adopci a společně vychovávali syna Oscara a dceru Avu.
Zdálo se, že mají idylické manželství a byli považováni za stabilní pár v Hollywoodu. Nicméně nedávno šokovali fanoušky oznámením o svém rozchodu. Ještě v dubnu Hugh Jackman na sociálních sítích oslavoval výročí svatby a chválil svou manželku jako úžasnou bytost. Příčiny rozchodu zatím nejsou veřejně známy, ale je jisté, že jejich manželství končí, a Deborra Lee-Furness a Hugh Jackman budou pokračovat ve svých životech odděleně.